A teoria dos jogos permite conceptualizar as escolhas estratégicas de indivíduos e organizações. Um jogo é uma estrutura matemática bem definida que inclui um conjunto de jogadores (indivíduos ou organizações), um conjunto de estratégias à disposição de cada um dos jogadores e uma especificação dos payoffs para cada combinação de estratégias. A teoria dos jogos é uma ferramenta poderosa para prever o resultado da interação entre agentes com objetivos próprios, por vezes conflituosos, quando a decisão de um afeta diretamente o payoff de outros. Tem sido aplicada a um número vasto de problemas, da análise da concorrência à política monetária, da licitação em leilões à definição de sistemas de incentivos em organizações, da negociação e resolução de conflitos a uma variedade de funções empresarias.

Já que as regras de um jogo determinam as decisões e o resultado final, a definição destas regras assume grande importância. O desenho de mercados, uma forma de engenharia económica que mistura a teoria dos jogos com as experiências, os algoritmos e as simulações, é uma área da economia em franca expansão. Aplicações de relevo do desenho de mercados são os mercados de afetação, onde os preços não desempenham o papel habitual de combinar os dois lados do mercado, como a colocação de professores em escolas públicas, estudantes em cursos universitários e a alocação de órgãos a pacientes que precisam de um transplante. O trabalho de Alvin E. Roth e Lloyd Shapley nesta área mereceu o prémio Nobel da Economia em 2012.